Předmět je teoreticky ukotven v rámci (neo)institucionální teorie, která k vysvětlení politických, ekonomických a sociálních důsledků přistupuje analýzou hlavních institucionálních aktérů, procesů a struktur. K hlavním institucionálním problémům v Latinské Americe, které budou v rámci předmětu diskutovány, náleží především: prezidencialismus, armáda jako instituce, latinskoamerické režimy a jejich analýza zejména z perspektivy podstaty a změn režimů (směrem k autoritarismu či směrem k demokracii), formování a charakter politických stran a (různorodě definovaných) hnutí, stranická typologie vázaná na latinskoamerický areál a v neposlední řadě také církevní instituce a její vliv na formování společnosti a státu. Dále nebudou opomenuta témata související s decentralizací, horizontálním rozložením moci a odpovědnosti, vládou práva a neformálními institucemi, jež často mohou převážit instituce formálního charakteru. Doktorand po absolvování kurzu dokáže analyzovat roli jednotlivých institucí a jejich pozici v rámci fungování státu.